通风系统设计主导思想：
实验室通风系统设计是实验室设计中的重中之重，也是
实验室建设成败的关键因素。实验室通风柜结构和设施、安全操作规程、安全设备适用于主要通过呼吸途径使人传染上严重的甚至是致死疾病的致病微生物及其毒素，通常已有预防传染的疫苗。实验室通风柜按归属可分为三类：第一类是从属于大学或者是由大学代管的实验室；第二类实验室属于国家机构，有的甚至是国际机构；第三类实验室直接归属于工业企业部门，为工业技术的开发与研究服务。实验室通风系统设计实验室的排风系统和补风系统两方面。
实验室排风系统的设计应根据《采暖通风与空气调 节设计规范》GB50019-2003，《民用建筑供暖通风空气调节设计规范》GB50736-2012等规范，通过实际实验室所需排风风量、管道长度、管道走向以及现场实际情况进行综合的分析计算，科学合理的设计排风系统，进而达到设计上实验室的安全、舒适、节能等目的。
补风系统，则应根据实验室类型的要求进行设计，一般理化实验室要求保持微负压（-5Pa—-10Pa）状态；个别特殊的生物安全实验室则有压力梯度的要求，如标准的PCR实验室四个功能区压力就是要求递减，试剂准备区（+5Pa）→样品制备区（+0Pa）→基因扩增区（-5Pa）→产物分析区（-10Pa）。这样的实验室在设计时需要通过送排风的控制来实现。
实验室通风系统
1 设计合理，使气流流向合理，不留死角或使其最小。实验室通风柜结构和设施、安全操作规程、安全设备适用于主要通过呼吸途径使人传染上严重的甚至是致死疾病的致病微生物及其毒素，通常已有预防传染的疫苗。生物安全实验室要求气流必须从清洁区流向感染区，室内送风口和排风口的位置应使气流停滞的空间降到最小，室内排风口应设置在最危险区域，单侧布置，不得有障碍。送风口不能对着生物安全柜吹，送风气流和生物安全柜工作窗口的保护气流互相干扰，将会使致病因子的泄露。
2 密闭性能可靠，包括实验室围护结构的密封性和空调通风管道的密封性。围护结构的密封性差主要是在门窗部位，建议窗户采用自然光照，设计建设成不能开启的，这样可以达到很好的密封，也能节省以后的运行费用，自然光照有利于实验室人员准确观察颜色。再就是隔墙的连接处密封性，空调通风管道的制作要规范符合要求，密封材料要合格。这些都是生物安全实验室要求的基本原则。
3 排风系统(system)的过滤器安装位置（position )要合理，不能把高效过滤器安装在排风机（Draught Fan）的正压端，这不能满足污染的排风段必须负压的要求。
4 高效过滤器的更换和检漏，特别是排风高效过滤器。排风高效过滤器更换前必须首先消毒灭菌，设计和安装时必须考虑（consider)消毒问题，同时便于更换。为了确保环境安全，排风高效过滤器也应考虑检漏的可能性，或采取其他确保不泄露的措施（指针对问题的解决办法)。我国很多P3实验室没有做到这一点。
5 室内安装分体空调或立柜式空调器，这在生物
洁净室中是不允许的，因为空调器中的换热器事实（Fact)上是一个微生物孳生装置，严重污染实验室环境。有的虽然把分体空调或立柜式空调器安装在邻近房间，用风管进行送风。但由于高级别生物安全实验室必须采用直流风，而普通空调的换热器是按室内循环（continue)风设计，达不到直流风要求的压差，再加上为了降低造价，设备容量没有富裕，根本达不到要求的室内温度。在高级别生物安全实验室做实验需要穿特制的防护服，有时需要穿多层，如果温度达不到要求，实验人员的感受会可想而知。
